מודלים מבניים מסייעים בהבנת הפונקציה של מקרומולקולות, בהסברת הפנוטיפ של מוטציות , בחקר האבולוציה של מכונות המורכבות מחלבונים, בתכנון חלבונים חדשים ומולקולות תרופה שיכולות לשלוט או לשנות פונקציה אנו מפתחים ומיישמים שיטות חישוביות לבניית מודלים מבניים של קומפלקסים מרובי חלבונים וחלבונים גמישים (בעלי מספר קונפורמציות) בעזרת אינטגרציה של מידע משיטות נסיוניות, פיזיקה וסטטיסטיקה: X-ray crystallography, NMR spectroscopy, 2D and 3D Electron Microscopy (EM), Small Angle X-ray Scattering (SAXS), Mass Spectrometry (MS), Hydrogen–deuterium exchange (HDX), mutations, force fields, sequence conservation and covariation אנו מפתחים שיטות חיזוי אפיטופים בעזרת מידול תלת מימדי של מבני התגובה החיסונית כגון אינטרקציות נוגדן-אנטיגן, חיתוך של חלבונים אנטיגנים ע״י תאים של מערכת חיסונית, הצגה של פפטידים אנטיגנים, זיהוי בעזרת רצפטורים והפעלת תגובה חיסונית